天博新算法揭示蛋白质进化秘密—新闻—科学网 来源：天博企业 发表时间: 2024-08-22

一个国际科研团队于9月13日出书的《天然》杂志上刊发论文称，他们开发出一种新算法，来比力“阿尔法折叠”数据库中所有已经猜测卵白质的布局，展现了差别物种卵白质之间的相似性。最新研究成果有助科学家理解卵白质的进化过程，并为人类免疫卵白质的发源提供了新见解。

新算法展现卵白质进化的�첩奥秘

图片来历：欧洲生物信息学研究所

苏黎世联邦理工学院科学家开发了名为“折叠搜刮聚类”的新算法，可同时阐发年夜量卵白质布局。研究团队将该算法运用在“阿尔法折叠”数据库中2亿个已经被猜测的卵白质布局，辨认出了200多万个怪异的布局聚类——一组于三维外形上相互相似的卵白质布局，此中1/3的聚类之前没有被描写或者分类。

研究团队指出，相识卵白质布局对于在研究其功效以及进化至关主要，只管科学家于基在序列的卵白质布局猜测方面取患了庞大进展，但计较限定使年夜范围研究这些布局变患上坚苦。折叠搜刮聚类算法能之前所未有的范围对于布局以及集群举行比力，将完成此类使命的时间削减了几个数目级：使用现无方法对于所有布局举行聚类需要10年，而使用折叠搜刮聚类只需5天时间。

研究还深切切磋了这些聚类于进化上的意思。虽然年夜大都聚类都很陈旧，但约4%的聚近似乎属在特定物种，为进化征象提供了新见解，如新基因怎样从基因组的非编码区域孕育发生。研究职员指出，这项事情不只是为了更有用地举行比力，并且能更好地相识卵白质的进化史。

这项研究中最有趣的发明之一是：人类免疫体系卵白质与细菌中发明的卵白质之间的布局具备相似性。这注解，人类介入免疫体系的卵白质可能与细菌物种有配合的陈旧的进化发源，这可能重塑人们对于免疫体系的理解，也为将来研究卵白质功效以及进化的秘密制订了线路图。

（原标题：对于比阐发“阿尔法折叠”数据库，新算法展现卵白质进化奥秘）

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