天博科学家首绘“植物界大熊猫”中华水韭基因组图谱—新闻—科学网 来源：天博企业 发表时间: 2024-04-05

北京农学院、中国农业科学院生物技能研究所团队初次绘制了高品质的中华水韭基因组图谱，这也是报导的首个非种子动物染色体程度拆卸的四倍体基因组，该研究为进一步剖析石松动物的进化以及情况顺应性和中华水韭的掩护提供了主要根蒂根基。

近日，相干研究以《经由过程染色体程度四倍体中华水韭基因组展现石松动物的进化以及顺应性》为题，揭晓于学术期刊《千兆科学》上。

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中华水韭。课题组供图

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中华水韭基因组图谱。课题组供图

中华水韭被以为是“动物界年夜熊猫”，是我国首批宣布的I级重点掩护野生动物，同时也是中国特有石松类动物。于所有维管动�첩物类群中，石松类动物的进化史最长，对于地球的生物多样性、泥土造成以及二氧化碳固定有着主要的影响。然而，与种子动物比拟，石松动物的漫衍面积年夜年夜缩小，石松属的几个物种已经经濒临灭尽。中华水韭是陈旧的四倍体（2n = 4x = 44）水生石松动物。中华水韭曾经经广泛漫衍，但此刻已经经从年夜部门栖息地消散了。中华水韭的基因组图谱的绘制，对于深切理解石松动物的进化及情况顺应性，和对于中华水韭的掩护有着主要意思。

此研究联合二代、三代基因组测序以及Hi-C数据，拆卸了包罗22条染色体2.13千兆的中华水韭四倍体基因组，其scaffold N50到达86.66兆。经由过程与近缘二倍体中国台湾水韭的比力阐发，展现了石松动物四倍体基因组以及多倍化的特性和中华水韭以及中国台湾水韭景天酸代谢路子和气孔发育的异同。经由过程与进化上代表性的物种的比力阐发，发明中华水韭具备的一些配合的遗传调控特征，如转录调控、脱落酸、细胞破裂素、乙烯、茉莉酸以及赤霉素旌旗灯号通路等。另外一方面，也发明了一些介入独角金内酯、水杨酸代谢以及勒迫反映（严寒、干旱、盐度以及镉）相干的主要基因，于中华水韭以及很多石松动物中“遗失”。这些发明为研究石松动物的发育及其对于窘境勒迫的顺应性提供了新的见解，为中华水韭的掩护提供了主要的信息。

据悉，北京农学院为第一完成单元，北京农学院园林学院高级试验师崔金腾以及中国农业科学院生物技能研究所客座研究生朱云柯为论文第一作者，中国农业科学院生物技能研究所研究员梁哲为论文通信作者，北京农学院园林学院本科生沈思仟、王曈昕、崔文文介入了此项研究事情。

相干论文信息：https://doi.org/10.1093/gigascience/giad079

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